Analyser
- Acanthamoeba DNA
- Acanthamoeba dyrkning
- Actinomyces dyrkningA
- Adenovirus, genotypingA
- Adenovirus PCRA
- Anti-DNase B antistoff (ADB; Gr. A streptokokk-serologi)A
- Anti-streptolysin O titer (ASL; Gr. A streptokokk-serologi)A
- Aspergillus DNA
- Aspergillus galaktomannan antigen
- Bacillus anthracis DNA
- Bakteriesekvensering (16S rRNA)
- Mikroskopi, barnemark (Enterobius vermicularis)
- Bartonella henselae PCR
- Beta-glukan
- BK virus DNA
- BK virus DNA kvantitering
- Blastomyces dermatitidis antistoff
- BlodkulturA
- Blodkultur (mykobakterier)
- Bordetella parapertussis PCR
- Bordetella pertussis (kikhoste) PCRA
- Borrelia burgdorferi antistoff us.A
- Borrelia DNA
- Borrelia IgG/IgM immunoblot
- Burkholderia cepacia dyrkningA
- Campylobacter jejuni IgA, IgM og IgG
- Chlamydia pneumoniae PCRA
- Lymphogranuloma venerum (LGV) PCR
- Chlamydia trachomatis PCRA
- Chlamydophila psittaci (ornitose) PCR
- Clostridioides difficile dyrkningA
- Clostridioides difficile genotyping
- Clostridioides difficile toksinpåvisningA
- Clostridium tetani IgG
- Coccidioides immitis/posadasii antistoff
- Corona virus (OC43, 229E, NL63, HKU1) PCRA
- Corynebacterium diphtheriae dyrkning
- Coxiella burnetii PCR
- Cytomegalovirus (CMV) IgGA
- Cytomegalovirus (CMV) IgMA
- Cytomegalovirus (CMV) PCRA
- Cytomegalovirus DNA kvantitering PCR
- Cytomegalovirus IgG aviditet
- Denguevirus antistoff/antigentest
- Dermatofytt typing (dyrkning)A
- Dyrkning av abscess/pussprøverA
- Dyrkning av autopsimaterialeA
- Dyrkning av biopsier/vevsprøverA
- Dyrkning av fæcesprøverA
- Dyrkning av genitalprøverA
- Dyrkning av intravasale kateterspisserA
- Dyrkning av morsmelkA
- Dyrkning av nedre luftveisprøverA
- Dyrkning av spinalvæskeA
- Dyrkning av sterile væsker, andreA
- Dyrkning av sårsekretA
- Dyrkning av urinA
- Dyrkning av ØNH-prøverA
- Dyrkning av øyeprøverA
- Echinococcus antistoff
- Echinococcus mikroskopi
- Enterohemoragisk E. coli (EHEC) undersøkelseA
- Enterovirus D68 PCR
- Enterovirus PCRA
- Empyem PCR
- Epstein-Barr virus (EBV) EBNA IgGA
- Epstein-Barr virus (EBV) VCA IgGA
- Epstein-Barr virus (EBV) VCA IgMA
- Epstein-Barr virus PCRA
- Epstein-Barr virus DNA kvantitering PCRA
- ESBL-screening, herunder karbapenemaseproduserende bakterier (ESBL-CARBA/CPO)
- Francisella agglutinasjon
- Francisella tularensis PCRA
- Vannfilter til Fransicella tularensis PCR
- Francisella tularensis dyrkning
- Francisella tularensis IgGA
- Francisella tularensis IgMA
- Francisella tularensis antistoff hurtigtest
- Tarmpatogene mikrober (multipleks PCR)A
- Gulfebervirus RNA
- Helicobacter pylori PCRA
- Helicobacter pylori dyrkning
- Helicobacter pylori IgGA
- Hepatitt A virus (HAV) IgGA
- Hepatitt A virus (HAV) IgMA
- Hepatitt B virus (HBV) core antistoffA
- Hepatitt B virus (HBV) s-antigenA
- Hepatitt B virus (HBV) s-antistoffA
- Hepatitt B virus core totalantistoff, alternativ test
- Hepatitt B virus PCR kvantiteringA
- Hepatitt B virus e-antigenA
- Hepatitt B virus e-antistoffA
- Hepatitt C virus (HCV) antistoffA
- Hepatitt C virus (HCV) RNA genotypeA
- Hepatitt D virus antistoff us.
- Hepatitt E virus totalantistoff us.
- Herpes simplex virus PCR (1 og 2)A
- Herpes simplex 1 og 2 virus totalantistoff us.A
- Histoplasma capsulatum antistoff
- HIV-1 resistensbestemmelse
- HIV-1/2 konfirmasjonstest
- HIV-1+HIV-2 antistoff+antigenA
- HIV-1 DNA (provirus)
- HIV-2 DNA (provirus)
- Humant bocavirus PCR
- Humant herpesvirus 6 PCRA
- Humant papillomavirus (HPV) PCR og typing
- Humant herpesvirus 7 PCR
- Humant herpesvirus 8 PCR
- Humant metapneumovirus PCR
- Humant parvovirus B19 totalantistoff us.A
- IGRA (Quantiferon)A
- Influensa A H5N1 (Fugleinfluensa) PCR
- Influensa A og B, hurtigtest
- Influensavirus A, B PCRA
- JC virus DNA
- Kingella Kingae PCR
- Kryptokokk antigen
- Legionella pneumphila PCR
- Legionella dyrkning
- Legionella pneumophila antigen (urin)A
- Leishmania DNA
- Leishmania mikroskopi
- Listeria monocytogenes PCRA
- Luftveispanel, akuttpanel
- Malaria antigen (hurtigtest)
- Malaria DNA
- Meningitt og encefalitt, akuttpanel (multiplex PCR)
- MRSA PCRA
- MERS Coronavirus PCR
- Mikroskopi, MalariaA
- Mononukleose Heterofile antistoffer
- Morbillivirus IgG
- Morbillivirus IgM
- Morbillivirus (meslinger) PCR
- MRSA-screeningA
- Mucorales DNA
- Mycobacterium tuberculosis PCRA
- M. tuberculosis kompleks PCR, hurtigtest (rifampicinresistens)
- Mycoplasma genitalium PCRA
- Mycoplasma genitalium PCR, mutasjonsanalyse (Makrolidresistens)
- Mycoplasma hominis PCR
- Mycoplasma pneumoniae PCRA
- Mycobacterium spp. dyrkningA
- Mikroskopi, Syrefaste staverA
- Neisseria gonorrhoeae (gonokokk) dyrkningA
- Neisseria gonorrhoeae PCRA
- Neisseria meningitidis PCR
- Nocardia dyrkning
- Norovirus og sapovirus PCRA
- Orfvirus PCR
- Parainfluensavirus 1,2,3,4 RNAA
- Parasitter mikroskopi (blod)A
- Mikroskopi, parasitter (fæces)A
- Parechovirus PCRA
- Parotittvirus IgG
- Parotittvirus IgM
- Parvovirus B19 PCRA
- Pneumocystis jirovecii PCRA
- Pneumokokk antigen (hurtigtest)
- Pseudomonas dyrkning
- Puumalavirus (hantavirus) IgG
- Puumalavirus antistoff (hantavirus)
- Reinbremslarve antistoff
- Respiratorisk syncytialt virus (RSV) PCRA
- Respiratorisk syncytialt virus (RSV) PCR, Hurtigtest
- Rhinovirus PCRA
- Rubellavirus IgGA
- S. aureus nuc gen PCR
- S. aureus eksfoliativt toksin gen (A+B) PCR
- S. aureus toksisk sjokk syndrom toksin 1 (TSST-1) PCR
- SARS-CoV-2 PCR
- SARS-CoV-2 PCR, Hurtigtest
- Schistosoma antistoff
- Schistosoma sp. DNA
- SoppdyrkingA
- Mikroskopi, Sopp
- Soppsekvensering
- Strongyloides IgG antistoff
- Streptococcus pneumoniae pneumolysin gen PCR
- Streptococcus pyogenes (GAS) PCRA
- Streptococcus agalactiae (GBS) PCR
- Streptococcus agalactiae (GBS) dyrkningA
- Streptokokk dyrkning (betahemlytiske, gruppe A, C, G)A
- Treponema pallidum (Syfilis) reagin test (RPR)A
- Tarmpatogene parasitter PCR, helminter
- Toxocara IgG
- Toxoplasma gondii PCR
- Toxoplasma gondii antistoff us.A
- Toxoplasma gondii IgG aviditet
- Treponema pallidum antistoff (syfilis) - screeningA
- Treponema pallidum IgM
- Trichomonas vaginalis PCRA
- Tropheryma whipplei PCR
- Trypanosoma cruzi IgG
- Ureaplasma parvum PCR
- Ureaplasma urealyticum PCR
- Vankomycinresistente enterokokker (VRE) – screening
- Varicella zoster virus PCRA
- Varicella zoster virus totalantistoff us.A
- Yersinia antistoff us.
- Zikavirus PCR
Clostridioides difficile genotyping
Sist oppdatert: 15.08.2025
Mer informasjon
Utgiver: St. Olavs hospital
Versjon: 1.0
Forfatter: Jan Egil Afset
Tidligere versjoner
Kopier lenke til dette emnet
Kopiert
Foreslå endringer/gi kommentarer
Indikasjon for prøvetaking
Genetisk karakterisering av Clostridioides difficile ved mistanke om utbrudd eller for virulenskarakterisering inkludert hypervirulens.
Prøvemateriale
Renkultur av Clostridioides difficile.
Rekvirering
Rekvireres av laboratoriet på grunnlag av påvist Clostridium difficile toksingen i fæces med påfølgende Clostridium difficile dyrkning.
Undersøkelsesprinsipp
Helgenomsekvensering.
Ved helgenomsekvensering karakteres bakterieioslateter i ulike sekvenstyper. En kan også kvantitere grad av genetisk ulikhet blant annet i antall SNP (single nucleotide polymorphism) forskjell mellom ulike bakterieisolater for å vurdere om isolater fra ulike pasienter er klonalt beslektet eller ikke. Det er godt samsvar mellom sekvenstype og tradisjonell ribotype, men helgenomsekvensering har bedre diskriminerede styrke enn ribotyping. Helgenomsekvensering kan også benyttes til å indentifisere hypervirulete stammer (ribotype 027 oh 078).
Utførende laboratorium
Avdeling for Medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital
Svar
Sekvenstype og assosiert ribotype, grad av slekskap med annen stamme.
Svartid
Normalt 1-3 uker.
Tolkning
Om aktuelle sekvenstype er forbudet med hypervirulens. Om det er klonalt slektskap meld andre epidemiologisk relaterte bakterieisolater.
Akkreditert
Analysen er ikke akkreditert.
Fortell oss gjerne hva du var fornøyd med eller misfornøyd med på denne nettsiden.
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
Vi kan ikke love deg svar på tilbakemeldingen din, men bruker den til å forbedre innholdet. Vi ber om at du ikke deler person- eller helseopplysninger.
