• Mistanke om infeksjon med SARS-CoV-2
• Alvorlig luftveisinfeksjon

SARS-CoV-2 er nå endemisk, men oppfører seg fortsatt ulikt de andre endemiske koronavirusene. SARS-CoV-2 gir mer alvorlig klinikk, og regelmessig sesongvariasjon er ennå ikke etablert.

Prøver fra pasienter med klinikk forenlig med SARS-CoV-2-infeksjon, undersøkes oftest med standard analysepakke bestående av PCR-tester for influensavirus A, influensavirus B, RS-virus og SARS-CoV-2. Ved behov for bredere diagnostikk finnes en alternativ PCR-pakke som inneholder tester for både virus og bakterier, tilsammen 23 ulike agens. Den alternative pakken er forbeholdt prøver fra sykehuspasienter.

• Nasofarynksprøve
• Halsprøve
• Ekspektorat
• Bronkialskyllevæske
• Spytt

Molekylærdiagnostikk.

Avdeling for Medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital

Positiv/negativ.

• Nasofarynks og hals: 4-6 timer etter mottak på laboratoriet.
• Nedre luftveier: 1-2 virkedager.

Positiv PCR bekrefter funn av SARS-CoV-2. Viruset kan forekomme i luftveier hos friske, ofte hos barn, uten å forårsake sykdom. Betydningen av funnet må derfor vurderes i lys av klinikk.

Moderat/høy virusmengde påvises vanligvis den første uken i sykdomsforløpet. I disse tilfellene besvares PCR-analysen uten resultatkommentar.

Mulig tolkning av positivt PCR-resultat besvart med kommentaren «Lav virusmengde»:

• Ikke klinisk betydning
  
  • Lave mengder av viruset kan være påvisbart i flere måneder etter infeksjon
• Klinisk betydning
  
  • Lav påvist mengde på grunn av dårlig tatt prøve
  • Lav virusproduksjon tidlig i sykdomsforløpet

Hvis ingen andre virus påvises, øker sannsynligheten for at funn av SARS-CoV-2 har klinisk betydning. 

Analysen er akkreditert etter ISO 15189.

Akkrediteringen gjelder nasofarynks, hals og spytt.

• Luftveisfunn Helse Midt-Norge (ukeoversikt) (Luftveisfunn)
• WHO: Novel coronavirus 2019
• FHI: Koronavirus