Ved mistanke om infeksiøs diare/gastroenteritt benyttes primært analysen Tarmpatogene mikrober PCR (multipleks PCR) for påvisning av et bredt panel av tarmpatogene bakterier, virus og parasitter. Ved funn av tarmpatogene bakterier kan prøven i tillegg bli dyrket for typing og eventuell resistensbestemmelse. I spesielle situasjoner vil det i tillegg bli gjort dyrkning (se under). Det er derfor avgjørende at gode kliniske opplysninger er angitt!
Se også Gastroenteritt.
Indikasjon for dyrkning i tillegg til PCR
Dyrkning av tarmpatogene bakterier.
Dyrkning gjøre for verifisere PCR-funn, for renkultur av bakterien for videre spesiecidentifikasjon, karakterisering/ subtyping av virulensgener, videre genotyping og eventuell resistenstesting.
Bakterie | Metodikk |
---|---|
Salmonella spp. | Serotyping ved agglutinasjon med antisera. |
Shigella spp./EIEC | Molekylære og biokjemiske metoder for å skille mellom Shigella og EIEC. Agglutinasjon med antisera for typebestemmelse av Shigella spp. |
Campylobacter spp. | Speciesidentifikasjon ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri. |
Yersinia enterocolitica | Agglutinasjon med antisera benyttes til å indetifisere de vansligste humanpatogene serotypene, og biokjemiske tester benyttes for å skille mellom apatogene og patogene biotyper. |
Vibrio spp. | Speciesidentifikasjon ved ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri. |
EHEC | Molekylær metode for å skille mellom STX 1 og 2, evt subtyping dersom funn av STX 2. |
Aeromonas spp. | Speciesidentifikasjon ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri. |
Plesiomonas spp. | Speciesidentifikasjon ved hjelp av MALDI-TOF massespektrometri. |
Clostridioides difficile | Dyrkning på kromogenagar, spesiesindentifikasjon av renkultur med MALDI-TOF massespektrometri, og påvisning av toksin B ved PCR. |
Avdeling for Medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital
Besvares som vekst av aktuelle tarmpatogene bakterieart. I tillegg kan svaret inneholde opplysning om serotype/subtype, virulensegenskaper, om bakterien anses som patogen, resistensprofil.
Kliniske opplysninger er viktig for at laboratoriet skal behandle prøven på best mulig måte:
Analysen er akkreditert etter ISO 15189.