Ved alvorlige infeksjoner der:  

• dyrking eller artsspesifikke analyser ikke fører frem, og/eller
• pasienten har fått antibiotika før prøvetaking, og/eller
• det foreligger mistanke om bakterier som er vanskelig å dyrke.

Ved behov for identifikasjon av bakteriekultur som ikke lar seg identifisere ved konvensjonelle metoder. 

Prøver fra normalt sterilt område.

Bakteriekultur.

• Prøver bør ankomme laboratoriet så raskt som mulig etter prøvetaking, helst innen 2 døgn for å unngå tap av mikrobielt DNA.
• Prøver må ikke fryses, men oppbevares i kjøleskap før forsendelse.
• Kan transporteres i romtemperatur. 

Molekylærdiagnostikk. 

Sanntids polymerasekjedereaksjon (PCR) for påvisning av bakterielt 16S rRNA-gen, etterfulgt av sekvensering dersom positivt resultat.

Påvist DNA-sekvens sammenliknes med kjente sekvenser fra databaser. Ved høy grad av overensstemmelse etter definerte kriterier utledes artsnavn, eventuelt slektsnavn.

Avdeling for Medisinsk mikrobiologi, St. Olavs Hospital

Bakterielt DNA: positiv/negativ

Videre sekvensert bakterielt DNA: taksonomi (mikrobenavn)

4–7 virkedager.

Analysen er følsom for kontaminering ifm. prøvetaking, samt fra laboratoriereagenser, utstyr og omgivelselser. Funnet bør alltid tolkes i lys av klinisk kontekst og eventuelle andre mikrobiologiske resultater. 

Analysens sensitivitet for alle bakteriearter kjennes ikke. Bakteriell infeksjon kan ikke utelukkes ved negativt resultat. 

• Spesifikke DNA-undersøkelser er mer sensitive og bør prioriteres når de er tilgjengelige.
• Analysen er ressurs- og tidkrevende. Analysen utføres derfor ikke på prøver med dårlig klinisk indikasjon eller hvor prøvematerialet er uegnet for analysen.
• Analysen er mindre egnet der det foreligger en blanding av flere bakterier i prøvematerialet.

Analysen er ikke akkreditert.